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DNA和蛋白质序列数据分析工具

作者:薛庆中 等编著

出版社:科学出版社

出版日期:2009年01月
内容简介
全书分9章。第1章,阐述序列比较的核心方法,即运用BLAST和ClustalX等工具做序列比对。第2章,重点介绍核苷酸序列分析工具,主要包括:基因可读框的识别,CpG岛、转录终止信号和启动子区域的预测分析,用mRNA序列预测基因等。第3章,介绍电子克隆的概念和具体操作方法。第4章,用MEGA4做分子进化遗传分析,绘制系统进化树,为研究基因进化打好基础。第5章,对蛋白质基本理化性质、二级结构、结构域和三维空间结构、预测目标蛋白的生物学功能等工具做逐一介绍。第6章,通过Gene Ontology和KEGG两个数据库,挖掘基因和蛋白质的功能并做代谢途径分析。第7章,利用X!Tandem软件鉴定蛋白质的串联质谱数据,进而预测蛋白质;同时借助TPP软件包进行蛋白质组学数据统计学分析,优化检索结果。第8章,使用TqVl4软件实现芯片的数据采集和标准化处理,并借助GenMAPP软件挖掘芯片数据的生物学意义。第9章,通过Cytoscape软件演示,介绍系统生物学分析概况,展示蛋白质-蛋白质相互作用,应用插件做网络结构分析。书后附有专业词中英文对照。
本书是为从事生物学、医学、农学及计算机科学等领域研究的研究生、大学生、教师、医生、研究人员、计算机工作人员提供的通俗易学的手册和工具。
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