《百年孤独》的叙事结构不同一般，马尔克斯采用了连环、环环相套、循环往复的叙事结构来展现小镇马孔多的历史。仿佛一个循环向上的气流。这种环环相套的结构，恰如其分地表现了小说的一个主题：人的孤独、封闭，以及由孤独封闭而造成的落后、消亡。作者对“孤独”这一具有民族特性的问题作了深刻的揭示。
小说描写的布恩蒂亚家族一代一代，“他们尽管相貌各异，肤色不同，脾性、个子各有差异，但从他们的眼神中，一眼便可辨认出那种这一家族特有的、绝对不会弄错的孤独眼神。”每个人，都无法逃脱被孤独所折磨的命运。乌苏娜在冗长的雨季中漫漫腐烂。阿玛兰塔一刻不停地缝自己和自己仇视了一生的女人——雷贝卡的裹尸布。雷贝卡足不出户，疯疯癫癫地过了后半生。青年时激进热血的奥雷良诺上校晚年开始在自己的实验室里做起了金属金鱼，但是他每做到二十条就熔掉他们重做。这象征着他父亲所开创的马贡多，乃至整个拉美的近代史，从一开始就陷入了循环的怪圈中。
让我印象很深的还有霍·布恩蒂亚第二和奥雷良诺第二，这对孪生兄弟。继承了父辈的名字，却表现出了完全相反的性格——霍·布恩蒂亚第二像奥雷良诺上校那样深沉，而奥雷良诺第二则像霍·布恩蒂亚那样不羁——以至于乌苏娜常常怀疑他们是否是在幼年时交换了名字。难道名字一定要和性格一样吗？这是一个深深的讽刺。而最后，两兄弟死去时又搞错了墓穴，仿佛这样才是正确的归属。