抗日战争期间，任国防最高委员会，同盟国中国战区最高统帅，“皖南事变”后，掀起第三次反共高潮。
在1937年—1945年期间，蒋介石成为中国最高抗战统帅，蒋介石领导200多万国民革命军坚持8八年抗战，蒋介石纵有千错万错，也不应该将其丑化矮化，也不应该将其全盘否定，蒋介石虽然有其过失之处，但仍不失为民族的领袖，不夸张地说，蒋介石是中国近现代史上的一个伟人；1943年参加美、英、中三国领导人参加的开罗会议。
抗日战争胜利后，与中共代表团在重庆进行和平谈判，1946年撕毁《停战协定》、《政协决议》，命令进攻共统区，单独召开制宪国民大会，通过宪法。
1948年擅自召开第一届国民大会，当选中华民国总统。
1949年，蒋介石父子退居台湾之后一直反对台独，反对美国分裂、“托管”台湾。
纵观中国近现代史，如果没有蒋介石，当时中国的台湾、东北被日本占领，中国将被各地军阀分割小国家，当时在中国当时唯一可以控制有全国各地军阀、中央军、黄埔系、准嫡系和嫡系拥有几百万军力的国民政府党、政、军非蒋介石，没有第二人，所以蒋介石的存在促进了中国领土完整的重要作用