突厥是公元6世纪初兴起于中国西北金山(今阿尔泰山)西南麓的一个游牧民族。隋朝时，以阿尔泰山为界，突厥汗国分为东、西两部分，分别称东,西突厥汗国.东突厥被薛延陀消灭，重建后的后突厥帝国被维吾尔族的祖先回纥人所灭。西突厥被唐朝所灭。
历史上突厥人统治过的许多部落，今天形成多个不同民族，分属不同国家。学术界把使用阿尔泰语系或突厥语族的各民族，概括为地称为“土耳其斯坦诸民族”，这些民族在中国有维吾尔，哈萨克，乌孜别克，柯尔克孜等民族，中国国外有阿塞拜疆，巴什基尔人，土耳其，雅库特人以及其他民族。维吾尔族血缘上与突厥人的关系并不密切。
土耳其斯坦这地区的历史可谓始于公元前2世纪初汉朝征服喀什噶尔之时。匈奴帝国瓦解后，所谓的东土耳其斯坦为中国所并吞。大约400年时，嚈哒(Hephthalites)在西突厥斯坦建立一个帝国。突厥人在6世纪时首次出现于此，并在河中(包括阿姆河〔奥克苏斯河〕以东地区)定居。
阿拉伯人在8世纪时征服河中，其后继者波斯萨曼(Samanid)王朝在此达到全盛时期。大约在同时，来自蒙古的维吾尔人占领了东突厥斯坦，他们一直是那里人口中的多数。整个土耳其斯坦历经不同的突厥人统治，直至以成吉思汗为首的蒙古人出现后方改观，蒙古人在1218年占领喀什噶尔，1220年占领河间地带。成吉思汗将突厥斯坦分配给其次子察合台，察合台的后裔后来又分裂成河间地带可汗和东突厥斯坦可汗两系。1369年帖木儿征服河间地带，并在撒马尔罕建都。帖木儿死后，敌对派系争夺其领土；1500年乌兹别克首领汗昔班尼(Shaybani Khan)取代了河中地区的帖木儿王朝。在近一百年不稳定的统治后，昔班尼王朝又为阿斯特拉罕王朝(Ashtarkhanid或Astrakhan)所取代。1740年，纳迪尔沙(Nadir Shah)又推翻了阿斯特拉罕王朝，在19世纪，西突厥斯坦基本上为3个相互敌对的汗国所控制：布哈拉(Bukhara)、希瓦(Khiva)和浩罕(Kokand)。